当院では、MFICU（Maternal Fetal Intensive Care Unit：母体胎児集中治療室）病床を9床併設していることから、近医より妊娠高血圧症候群や胎児発育不全、多胎妊娠、切迫流・早産、胎盤位置異常などの産科合併症の紹介も数多く受け入れております。新生児科との連携により、急変時の母児の管理を可能としております。さまざまな合併症を伴ったリスクの高い帝王切開による分娩も積極的に受け入れています。また、産科と麻酔科が連携し、安心・安全な無痛分娩にも取り組んでおります。
（注）正常分娩や無痛分娩は、自費診療（DPC対象外症例）のため上記対象外となります。

当院では、女性器に発生する類腫瘍病変・良性腫瘍・前癌病変を対象に治療を行っており、子宮筋腫や卵巣腫瘍、子宮腺筋症、子宮内膜症、子宮内膜ポリープ、子宮頸部上皮内癌等の手術を数多く行っており、安全な手術の実施と治療の標準化により全国平均よりも早期退院となるよう努めております。また、生殖内分泌外来では、体外受精や顕微授精などの高度生殖補助医療も積極的に行っています。

当院では、NICU（Neonatal Intensive Care Unit：新生児集中治療室）は21床で、ハイリスク新生児に対して呼吸・循環管理を行っております。
当科は、地域周産期母子医療センターとして当院分娩の児だけでなく、近隣の病院で出生した入院加療の必要な新生児の搬送も24時間体制で受け入れています。同フロアに後方病棟としてGCU（Growing Care Unit：新生児回復治療室）が41床あり、それぞれ連携しながら医療・看護を行っています。

2025年7月1日より新たに「ブレストセンター」を開設いたしました。
乳がんの早期発見・診断から、手術（乳房部分切除、全切除、センチネルリンパ節生検等）、薬物療法（ホルモン療法、化学療法等）、
再発後の治療まで、患者様の症状に応じた診療を行っています。また、院内の産科とも連携し、診療に取り組んでいます。
（注）10症例未満は「-」にて表示しております。

当院では、熊本県の周産期三次救急を担う地域周産期母子医療センターとしての役割を有しています。分娩件数は年間約4,000件ほどで、最も多い症例は帝王切開手術（緊急ならびに予定）を行った入院が上位となります。緊急の母体搬送の受け入れや緊急帝王切開手術にも24時間体制で対応しています。また、適応であればVBAC（帝王切開後の経腟分娩）も行っています。

当院では、子宮鏡下による子宮内膜ポリープ切除術や子宮筋腫・卵巣腫瘍などの良性疾患に対して腹腔鏡下手術を積極的に行っています。そして、子宮頸部異形成や上皮内癌の治療として、入院で円錐切除術や外来でレーザー蒸散法も行っています。悪性腫瘍に対しては、高次機能病院へ紹介させていただいております。また、子宮筋腫・子宮腺筋症などによる過多月経の治療として子宮内膜アブレーション（MEA）も導入しております。
（注）10症例未満は「-」にて表示しております。

新生児科の入院症例として主に手術として取り扱われるものは、分娩後仮死状態で出生した新生児に対する蘇生処置になります。
術後日数は、未熟児（早産児、低出生体重児）であるために長期間の入院加療を必要とします。
新生児仮死蘇生術（仮死第2度）の転院率が高くなっているのは、新生児低酸素性虚血性脳症に対する低体温療法を医師が必要と判断した場合、高次機能病院へ搬送とするからです。これらのほかに、先天性の消化器系疾患に対する手術や未熟児網膜症に対する光凝固術などを必要とする場合は高次機能病院へ転院としています。

手術によってがんを切除することを目的としていますが、主な手術には、「乳房部分切除術（乳房温存手術）」と「乳房全切除術」があります。
当院では、2025年7月にブレストセンターを開設し、同年9月より乳腺外科の手術を開始しました。そのため、2025年度は実施期間が限られており、件数が少なくなっています。
（注）10症例未満は「-」にて表示しております。